Oprócz spraw związanych z przygotowaniem nowego modelu rynku energii elektrycznej skojarzonej z handlem świadectwami pochodzenia, co opisano w rozdziale Prawo energetyczne, działalność PTEZ w obszarze rynku energii elektrycznej obejmowała także:

• Kwestię likwidacji kontraktów długoterminowych (KDT) na dostawy energii elektrycznej dla PSE S.A. Prace nad tym zagadnieniem trwają od początku 2003 r., kiedy to przyjęty został przez Radę Ministrów dokument pt. „Aktualizacja programu wprowadzania konkurencyjnego rynku energii elektrycznej w Polsce”.
  W roku 2006 PTEZ wnosiło uwagi do kolejnej wersji projektu ustawy o zasadach pokrywania kosztów w przedsiębiorstwach w związku z przedterminowym rozwiązaniem KDT. Były to uwagi natury ogólnej, a także szczegóły do samych zapisów. Szczególnie mocno zwracano uwagę na pomijanie problemów dot. gospodarki skojarzonej a także kontraktów gazowych.  

• Udział w pracach powołanego przez MG Zespołu do analizy zakłóceń systemu elektroenergetycznego. W sumie odbyło się 7 posiedzeń Zespołu, wynikiem których był raport o przyczynach i skutkach oraz propozycjach działań zapobiegawczych awariom systemu elektroenergetycznego. Uwagi wnoszone przez PTEZ nie zostały uwzględnione. Ostateczna wersja raportu została przygotowana bez udziału Zespołu. PTEZ nie zgadza się z wnioskami zapisanymi w opublikowanej wersji raportu.